##fileformat=VCFv4.1
##samtoolsVersion=0.1.18 (r982:295)
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Raw read depth">
##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Integer,Description="Root-mean-square mapping quality of covering reads">
##INFO=<ID=FQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred probability of all samples being the same">
##INFO=<ID=AF1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele frequency (assuming HWE)">
##INFO=<ID=AC1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele count (no HWE assumption)">
##INFO=<ID=G3,Number=3,Type=Float,Description="ML estimate of genotype frequencies">
##INFO=<ID=HWE,Number=1,Type=Float,Description="Chi^2 based HWE test P-value based on G3">
##INFO=<ID=CLR,Number=1,Type=Integer,Description="Log ratio of genotype likelihoods with and without the constraint">
##INFO=<ID=UGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable unconstrained genotype configuration in the trio">
##INFO=<ID=CGT,Number=1,Type=String,Description="The most probable constrained genotype configuration in the trio">
##INFO=<ID=PV4,Number=4,Type=Float,Description="P-values for strand bias, baseQ bias, mapQ bias and tail distance bias">
##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL.">
##INFO=<ID=PC2,Number=2,Type=Integer,Description="Phred probability of the nonRef allele frequency in group1 samples being larger (,smaller) than in group2.">
##INFO=<ID=PCHI2,Number=1,Type=Float,Description="Posterior weighted chi^2 P-value for testing the association between group1 and group2 samples.">
##INFO=<ID=QCHI2,Number=1,Type=Integer,Description="Phred scaled PCHI2.">
##INFO=<ID=PR,Number=1,Type=Integer,Description="# permutations yielding a smaller PCHI2.">
##INFO=<ID=VDB,Number=1,Type=Float,Description="Variant Distance Bias">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Float,Description="Likelihoods for RR,RA,AA genotypes (R=ref,A=alt)">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="# high-quality bases">
##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="List of Phred-scaled genotype likelihoods">
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	NA12878
20	61098	.	C	T	178	.	.	GT:PL:GQ	0/1:208,0,255:99
20	61795	.	G	T	163	.	.	GT:PL:GQ	0/1:193,0,255:99
20	63244	.	A	C	174	.	.	GT:PL:GQ	0/1:204,0,255:99
20	63799	.	C	T	86	.	.	GT:PL:GQ	0/1:116,0,255:99
20	65900	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	66370	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	66720	.	C	A	114	.	.	GT:PL:GQ	0/1:144,0,255:99
20	67500	.	TTGGTAT	TTGGTATCTAGTGGTAT	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	68749	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,217,0:99
20	70484	.	CTCTTTCT	CTCT	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	70980	.	G	A	168	.	.	GT:PL:GQ	0/1:198,0,255:99
20	72104	.	TAAAA	TAAA	163	.	.	GT:PL:GQ	0/1:201,0,200:99
20	72892	.	G	A	107	.	.	GT:PL:GQ	0/1:137,0,255:99
20	74347	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	76771	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	76962	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,253,0:99
20	79234	.	T	C	101	.	.	GT:PL:GQ	0/1:131,0,255:99
20	80481	.	G	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	80655	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,207,0:99
20	82012	.	T	C	140	.	.	GT:PL:GQ	0/1:170,0,255:99
20	82074	.	A	C	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:247,144,0:99
20	82079	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,157,0:99
20	82217	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,157,0:99
20	83275	.	T	C	30	.	.	GT:PL:GQ	0/1:60,0,74:63
20	90008	.	C	A	127	.	.	GT:PL:GQ	1/1:160,202,0:99
20	91088	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	91508	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	91707	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	92527	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,214,0:99
20	93440	.	A	G	182	.	.	GT:PL:GQ	0/1:212,0,255:99
20	93931	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	100699	.	C	T	131	.	.	GT:PL:GQ	0/1:161,0,255:99
20	101362	.	G	A	153	.	.	GT:PL:GQ	0/1:183,0,255:99
20	102181	.	T	C	133	.	.	GT:PL:GQ	0/1:163,0,255:99
20	102799	.	G	A	164	.	.	GT:PL:GQ	0/1:194,0,255:99
20	103517	.	A	T	160	.	.	GT:PL:GQ	0/1:190,0,255:99
20	104899	.	C	T	122	.	.	GT:PL:GQ	0/1:152,0,255:99
20	106635	.	G	A	177	.	.	GT:PL:GQ	0/1:207,0,255:99
20	108286	.	T	G	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	108328	.	A	C	204	.	.	GT:PL:GQ	1/1:237,255,0:99
20	110058	.	G	C	180	.	.	GT:PL:GQ	0/1:210,0,255:99
20	110098	.	A	G	178	.	.	GT:PL:GQ	0/1:208,0,255:99
20	110702	.	C	T	114	.	.	GT:PL:GQ	0/1:144,0,244:99
20	112877	.	C	T	72	.	.	GT:PL:GQ	0/1:102,0,123:99
20	116787	.	A	G	75	.	.	GT:PL:GQ	0/1:105,0,154:99
20	117309	.	GCAGGATTTCATCAGG	GCAGGATTTCATCAGGATTTCATCAGG	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	119645	.	GTT	GTTT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,162,0:99
20	120122	.	AA	AAGA	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,247,0:99
20	120471	.	A	G	182	.	.	GT:PL:GQ	0/1:212,0,255:99
20	120754	.	T	TAATC	215	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,9,0:16
20	121310	.	A	C	86	.	.	GT:PL:GQ	0/1:116,0,255:99
20	121478	.	C	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,239:99
20	121497	.	TCTC	T	78.5	.	.	GT:PL:GQ	0/1:116,0,255:99
20	121824	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	121976	.	G	A	170	.	.	GT:PL:GQ	0/1:200,0,255:99
20	122508	.	G	A	123	.	.	GT:PL:GQ	0/1:153,0,255:99
20	122806	.	TTATATATATATAT	TTATATATATATATAT	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	124302	.	A	C	166	.	.	GT:PL:GQ	0/1:196,0,255:99
20	124412	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	125538	.	G	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	126155	.	GCAAACAAA	GCAAA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	126310	.	ACCCCC	ACCC	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	126529	.	G	A	161	.	.	GT:PL:GQ	1/1:194,217,0:99
20	126600	.	C	A	216	.	.	GT:PL:GQ	1/1:249,211,0:99
20	126614	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,241,0:99
20	126730	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,220,0:99
20	126760	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,202,0:99
20	126923	.	C	A	171	.	.	GT:PL:GQ	1/1:204,244,0:99
20	126930	.	A	T	186	.	.	GT:PL:GQ	1/1:219,235,0:99
20	127720	.	A	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,208,0:99
20	128713	.	C	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	129613	.	G	A	213	.	.	GT:PL:GQ	1/1:246,255,0:99
20	129736	.	G	A	64	.	.	GT:PL:GQ	0/1:94,0,255:97
20	129864	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	131362	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,235,0:99
20	131495	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,226,0:99
20	131505	.	CTCTT	CT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,238,0:99
20	131657	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	131948	.	CCACACACACACACACA	CCACACACACACACACACA	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,123,0:99
20	132304	.	TAAAAAAAAAAA	TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA	44.5	.	.	GT:PL:GQ	1/1:85,119,0,85,116,82:99
20	133158	.	T	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,166,0:99
20	134017	.	A	G	211	.	.	GT:PL:GQ	1/1:244,169,0:99
20	134284	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,132,0:99
20	134366	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,178,0:99
20	134421	.	C	T	212	.	.	GT:PL:GQ	1/1:245,178,0:99
20	134428	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	CAAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAAA	178	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,114,36,255,0,248:99
20	134476	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,241,0:99
20	134643	.	C	T	200	.	.	GT:PL:GQ	1/1:233,184,0:99
20	134844	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,244,0:99
20	134931	.	T	G	202	.	.	GT:PL:GQ	1/1:235,255,0:99
20	135488	.	C	T	165	.	.	GT:PL:GQ	1/1:198,220,0:99
20	137127	.	A	G	218	.	.	GT:PL:GQ	1/1:251,217,0:99
20	137518	.	GTATATATATATATATATAT	GTATATATATATATATAT	54.5	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,160:99
20	137674	.	G	A	197	.	.	GT:PL:GQ	1/1:230,205,0:99
20	137933	.	C	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,220,0:99
20	138004	.	G	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,196,0:99
20	138178	.	GCC	GC	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,214,0:99
20	138563	.	AATATATATAT	AATATATAT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,63,0:99
20	138603	.	T	C	33	.	.	GT:PL:GQ	1/1:66,24,0:44
20	139362	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,229,0:99
20	139745	.	T	C	183	.	.	GT:PL:GQ	1/1:216,244,0:99
20	139841	.	A	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,253,0:99
20	139915	.	TAAAAAAAAAAA	TAAAAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAAAAAAA	133	.	.	GT:PL:GQ	1/1:174,141,0,145,59,133:99
20	140086	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	140280	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,232,0:99
20	140396	.	TTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG	TTTGTTGTTGTTGTTGTTG	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,208,0:99
20	142021	.	G	A	137	.	.	GT:PL:GQ	1/1:170,160,0:99
20	142229	.	T	C	108	.	.	GT:PL:GQ	1/1:141,87,0:99
20	142279	.	C	A	32	.	.	GT:PL:GQ	1/1:65,39,0:67
20	143447	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,128,0:99
20	143918	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,226,0:99
20	144382	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,253,0:99
20	144535	.	A	C	204	.	.	GT:PL:GQ	1/1:237,255,0:99
20	144560	.	T	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,244,0:99
20	144570	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,232,0:99
20	144832	.	CTT	CTTT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,96,0:99
20	144884	.	CCTTCTT	CCTT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,114,0:99
20	144899	.	T	C	169	.	.	GT:PL:GQ	1/1:202,126,0:99
20	145210	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,166,0:99
20	145257	.	G	GC	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,172,0:99
20	145413	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,163,0:99
20	145715	.	AACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA	AACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA	115	.	.	GT:PL:GQ	0/1:153,0,255:99
20	146995	.	A	T	204	.	.	GT:PL:GQ	1/1:237,166,0:99
20	148084	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,193,0:99
20	148480	.	T	C	159	.	.	GT:PL:GQ	1/1:192,205,0:99
20	149407	.	C	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,208,0:99
20	149975	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,181,0:99
20	151330	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,226,0:99
20	152533	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,205,0:99
20	152570	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,217,0:99
20	152797	.	G	A	188	.	.	GT:PL:GQ	0/1:218,0,249:99
20	152972	.	T	C	198	.	.	GT:PL:GQ	1/1:231,169,0:99
20	152992	.	C	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,169,0:99
20	153267	.	T	C	188	.	.	GT:PL:GQ	1/1:221,226,0:99
20	153298	.	TT	TTCT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,187,0:99
20	153393	.	C	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,235,0:99
20	153691	.	T	C	160	.	.	GT:PL:GQ	1/1:193,190,0:99
20	154614	.	T	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,194,0:99
20	154710	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,230:99
20	155910	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,208,0:99
20	155955	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,238,0:99
20	156165	.	C	G	179	.	.	GT:PL:GQ	1/1:212,184,0:99
20	156173	.	C	T	196	.	.	GT:PL:GQ	1/1:229,172,0:99
20	156329	.	G	C	179	.	.	GT:PL:GQ	1/1:212,129,0:99
20	156330	.	G	T	153	.	.	GT:PL:GQ	1/1:186,129,0:99
20	156534	.	C	T	165	.	.	GT:PL:GQ	1/1:198,87,0:99
20	156538	.	C	T	130	.	.	GT:PL:GQ	1/1:163,90,0:99
20	157157	.	T	C	168	.	.	GT:PL:GQ	1/1:201,196,0:99
20	157272	.	C	T	108	.	.	GT:PL:GQ	0/1:138,0,255:99
20	157522	.	C	T	184	.	.	GT:PL:GQ	0/1:214,0,255:99
20	157746	.	A	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	157976	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,172,0:99
20	158114	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,193,0:99
20	158315	.	G	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,144,0:99
20	158434	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,192,0:99
20	158495	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,189,0:99
20	159289	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,175,0:99
20	160111	.	ATTTTTTTTTT	ATTTTTTTTTTT	32.5	.	.	GT:PL:GQ	1/1:73,151,0:99
20	160208	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,229,0:99
20	160533	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	160551	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	161450	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	162683	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,232,0:99
20	163607	.	A	AAT	214	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,223,0:99
20	163743	.	CACACA	CACACATACACA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,186:99
20	164279	.	GAAAA	GAAAACAAAA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,184:99
20	164340	.	A	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	165908	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	166727	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	166824	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,255,0:99
20	167310	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,232,0:99
20	167431	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,217,0:99
20	168080	.	A	G	190	.	.	GT:PL:GQ	1/1:223,184,0:99
20	168466	.	T	A	190	.	.	GT:PL:GQ	1/1:223,114,0:99
20	168728	.	T	A	202	.	.	GT:PL:GQ	1/1:235,199,0:99
20	169701	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,196,0:99
20	169995	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,175,0:99
20	170589	.	T	C	175	.	.	GT:PL:GQ	1/1:208,190,0:99
20	170642	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,169,0:99
20	171189	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,160,0:99
20	171591	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,148,0:99
20	171627	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,166,0:99
20	172518	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,244,0:99
20	172741	.	G	T	185	.	.	GT:PL:GQ	1/1:218,226,0:99
20	173751	.	G	A	205	.	.	GT:PL:GQ	1/1:238,255,0:99
20	174069	.	A	G	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,217,0:99
20	175387	.	G	A	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,205,0:99
20	176386	.	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	160	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,151,54:99
20	179735	.	TTAAAATAAAA	TTAAAA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	198395	.	GTATATATATATATATATA	GTATATATATATATATATATA	200	.	.	GT:PL:GQ	0/1:238,0,243:99
20	206596	.	C	T	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,250,0:99
20	211564	.	T	C	158	.	.	GT:PL:GQ	0/1:188,0,255:99
20	212539	.	C	T	67	.	.	GT:PL:GQ	1/1:100,60,0:99
20	212541	.	G	C,T	68	.	.	GT:PL:GQ	1/1:101,48,0,94,29,91:93
20	212674	.	AAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA	AAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA	142	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,77,79:5
20	214373	.	T	C	182	.	.	GT:PL:GQ	0/1:212,0,255:99
20	215082	.	C	T	147	.	.	GT:PL:GQ	0/1:177,0,255:99
20	216750	.	T	C	220	.	.	GT:PL:GQ	1/1:253,214,0:99
20	216811	.	C	T	175	.	.	GT:PL:GQ	0/1:205,0,255:99
20	217074	.	G	A	209	.	.	GT:PL:GQ	0/1:239,0,255:99
20	217281	.	G	A	157	.	.	GT:PL:GQ	0/1:187,0,255:99
20	217851	.	T	C	222	.	.	GT:PL:GQ	1/1:255,135,0:99
20	218255	.	A	AG	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	219011	.	A	G	132	.	.	GT:PL:GQ	0/1:162,0,255:99
20	219099	.	C	G	194	.	.	GT:PL:GQ	0/1:224,0,255:99
20	219362	.	G	A	182	.	.	GT:PL:GQ	0/1:212,0,255:99
20	220059	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	220197	.	C	T	133	.	.	GT:PL:GQ	0/1:163,0,255:99
20	220204	.	T	G	170	.	.	GT:PL:GQ	0/1:200,0,255:99
20	220444	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	221942	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	222539	.	C	CA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	222674	.	G	A	114	.	.	GT:PL:GQ	0/1:144,0,255:99
20	222708	.	T	C	89	.	.	GT:PL:GQ	0/1:119,0,255:99
20	222836	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	222994	.	A	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	223172	.	T	C	118	.	.	GT:PL:GQ	0/1:148,0,255:99
20	223255	.	T	G	154	.	.	GT:PL:GQ	0/1:184,0,255:99
20	223439	.	G	A	119	.	.	GT:PL:GQ	0/1:149,0,255:99
20	223538	.	T	C	189	.	.	GT:PL:GQ	0/1:219,0,255:99
20	223858	.	A	G	162	.	.	GT:PL:GQ	0/1:192,0,255:99
20	224128	.	T	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	224173	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	224601	.	G	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	224941	.	T	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	224971	.	G	A	185	.	.	GT:PL:GQ	0/1:215,0,255:99
20	225058	.	A	G	169	.	.	GT:PL:GQ	0/1:199,0,255:99
20	225412	.	T	C	85	.	.	GT:PL:GQ	0/1:115,0,255:99
20	225444	.	T	C	186	.	.	GT:PL:GQ	0/1:216,0,255:99
20	225768	.	G	A	109	.	.	GT:PL:GQ	0/1:139,0,255:99
20	226084	.	GTATATATATATATATATATATATATATATA	GTATATATATATATATATATATA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,172:99
20	226444	.	A	G	154	.	.	GT:PL:GQ	0/1:184,0,255:99
20	226518	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	226789	.	T	A	187	.	.	GT:PL:GQ	0/1:217,0,255:99
20	227024	.	G	A	129	.	.	GT:PL:GQ	0/1:159,0,255:99
20	227142	.	G	T	117	.	.	GT:PL:GQ	0/1:147,0,255:99
20	227246	.	A	G	68	.	.	GT:PL:GQ	0/1:98,0,255:99
20	227967	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	228206	.	A	C	115	.	.	GT:PL:GQ	0/1:145,0,255:99
20	228577	.	G	A	158	.	.	GT:PL:GQ	0/1:188,0,255:99
20	229456	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,250:99
20	229495	.	T	C	148	.	.	GT:PL:GQ	0/1:178,0,255:99
20	229722	.	T	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	229730	.	CAAAAAAAAAAAAA	CAAAAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAAAAAA	33.7	.	.	GT:PL:GQ	0/1:71,0,10,76,19,54:13
20	229978	.	G	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	230053	.	C	T	154	.	.	GT:PL:GQ	0/1:184,0,255:99
20	230058	.	CATAAA	CAAA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	230177	.	A	T	176	.	.	GT:PL:GQ	0/1:206,0,255:99
20	230516	.	T	A	118	.	.	GT:PL:GQ	0/1:148,0,255:99
20	230541	.	A	T	121	.	.	GT:PL:GQ	0/1:151,0,255:99
20	230859	.	C	T	139	.	.	GT:PL:GQ	0/1:169,0,249:99
20	230983	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	231090	.	C	T	143	.	.	GT:PL:GQ	0/1:173,0,255:99
20	231312	.	A	C	129	.	.	GT:PL:GQ	0/1:159,0,255:99
20	231505	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,246:99
20	232107	.	G	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,242:99
20	232580	.	G	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	232634	.	TACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA	TACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA	181	.	.	GT:PL:GQ	0/1:219,0,234:99
20	233623	.	A	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	233879	.	C	A	182	.	.	GT:PL:GQ	1/1:215,205,0:99
20	234179	.	A	G	116	.	.	GT:PL:GQ	0/1:146,0,255:99
20	234360	.	C	T	146	.	.	GT:PL:GQ	0/1:176,0,255:99
20	235107	.	A	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	235722	.	G	A	156	.	.	GT:PL:GQ	0/1:186,0,243:99
20	235970	.	C	G	103	.	.	GT:PL:GQ	0/1:133,0,255:99
20	236088	.	T	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	236168	.	T	C	165	.	.	GT:PL:GQ	0/1:195,0,219:99
20	236238	.	G	A	83	.	.	GT:PL:GQ	0/1:113,0,204:99
20	236286	.	A	G	187	.	.	GT:PL:GQ	0/1:217,0,243:99
20	236328	.	A	C	86	.	.	GT:PL:GQ	0/1:116,0,232:99
20	236419	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,243:99
20	236459	.	GATATATATATATATATATATATATATAT	GATATATATATATATATATATATATATATAT	108	.	.	GT:PL:GQ	0/1:146,0,143:99
20	236802	.	C	T	155	.	.	GT:PL:GQ	0/1:185,0,255:99
20	236992	.	C	T	155	.	.	GT:PL:GQ	0/1:185,0,255:99
20	237052	.	G	C	112	.	.	GT:PL:GQ	0/1:142,0,255:99
20	237418	.	G	A	61	.	.	GT:PL:GQ	0/1:91,0,255:94
20	237497	.	A	G	73	.	.	GT:PL:GQ	0/1:103,0,255:99
20	237545	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	237569	.	C	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	237618	.	A	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	237649	.	CAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA	CAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	237816	.	ATTTT	ATTTTT	96.5	.	.	GT:PL:GQ	0/1:134,0,206:99
20	238020	.	C	T	127	.	.	GT:PL:GQ	0/1:157,0,255:99
20	238435	.	CTGGTCTTGG	CTGG	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	238507	.	A	C	95	.	.	GT:PL:GQ	0/1:125,0,255:99
20	238530	.	T	G	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	238540	.	C	T	179	.	.	GT:PL:GQ	0/1:209,0,255:99
20	238737	.	C	T	159	.	.	GT:PL:GQ	0/1:189,0,255:99
20	239294	.	T	C	150	.	.	GT:PL:GQ	0/1:180,0,255:99
20	239410	.	C	T	87	.	.	GT:PL:GQ	0/1:117,0,255:99
20	239420	.	A	T	38	.	.	GT:PL:GQ	0/1:68,0,255:71
20	239664	.	T	C	204	.	.	GT:PL:GQ	0/1:234,0,255:99
20	239688	.	G	A	145	.	.	GT:PL:GQ	0/1:175,0,255:99
20	239697	.	G	C	173	.	.	GT:PL:GQ	0/1:203,0,255:99
20	240704	.	T	A	71	.	.	GT:PL:GQ	0/1:101,0,255:99
20	240706	.	T	A	71	.	.	GT:PL:GQ	0/1:101,0,255:99
20	241234	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	241366	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	241638	.	G	A	150	.	.	GT:PL:GQ	0/1:180,0,255:99
20	242409	.	G	A	221	.	.	GT:PL:GQ	0/1:251,0,255:99
20	242615	.	G	T	187	.	.	GT:PL:GQ	0/1:217,0,255:99
20	242685	.	G	A	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	242694	.	T	C	172	.	.	GT:PL:GQ	0/1:202,0,255:99
20	242798	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,230:99
20	243223	.	CT	CTT	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	243352	.	G	T	168	.	.	GT:PL:GQ	0/1:198,0,255:99
20	243398	.	G	C	178	.	.	GT:PL:GQ	0/1:208,0,255:99
20	243679	.	A	C	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
20	243924	.	C	A	161	.	.	GT:PL:GQ	0/1:191,0,255:99
20	244092	.	C	G	161	.	.	GT:PL:GQ	0/1:191,0,255:99
20	244120	.	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	47.5	.	.	GT:PL:GQ	0/1:85,0,255:88
20	244333	.	A	G	159	.	.	GT:PL:GQ	0/1:189,0,255:99
20	244373	.	C	T	220	.	.	GT:PL:GQ	0/1:250,0,249:99
20	244985	.	G	A	163	.	.	GT:PL:GQ	0/1:193,0,255:99
20	245466	.	T	G	198	.	.	GT:PL:GQ	0/1:228,0,255:99
20	245690	.	C	T	225	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,208:99
20	245935	.	G	T	155	.	.	GT:PL:GQ	0/1:185,0,255:99
20	246255	.	C	T	159	.	.	GT:PL:GQ	0/1:189,0,255:99
20	246483	.	TTAAATAAATAAATAAATAAAT	TTAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	217	.	.	GT:PL:GQ	0/1:255,0,255:99
