C = Atom('C')
C_alpha = Atom('CH')
N = Atom('NH')
O = Atom('O')
O_2 = Atom('O')
bonds = [Bond(N, C_alpha), Bond(C_alpha, C), Bond(C, O), Bond(C, O_2), ]
pdbmap = [('', {'C': C, 'O': O, 'CA': C_alpha, 'N': N, 'OXT': O_2, }, ), ]
amber_atom_type = {C: 'C', N: 'N', O: 'O2', C_alpha: 'CT', O_2: 'O2', }
pdb_alternative = {'O1': 'O', 'O2': 'OXT', 'HN': 'H', 'OT': 'OXT', 'OT2': 'OXT', 'OT1': 'O', 'OC2': 'OXT', 'OC1': 'O', }
name = 'peptide C terminus'
