H_epsilon_2 = Atom('h')
H_epsilon_3 = Atom('h')
C_epsilon = Atom('c')
H_epsilon_1 = Atom('h')
S_delta = Atom('s')
C_beta = Atom('c')
H_gamma_3 = Atom('h')
H_gamma_2 = Atom('h')
C_gamma = Atom('c')
H_beta_3 = Atom('h')
H_beta_2 = Atom('h')
bonds = [Bond(H_beta_2, C_beta), Bond(H_beta_3, C_beta), Bond(C_gamma, C_beta), Bond(H_gamma_2, C_gamma), Bond(H_gamma_3, C_gamma), Bond(S_delta, C_gamma), Bond(C_epsilon, S_delta), Bond(H_epsilon_1, C_epsilon), Bond(H_epsilon_2, C_epsilon), Bond(H_epsilon_3, C_epsilon), ]
name = 'met_sidechain'
pdbmap = [('MET', {'SD': S_delta, '2HG': H_gamma_2, '2HE': H_epsilon_2, '2HB': H_beta_2, '1HE': H_epsilon_1, '3HG': H_gamma_3, '3HE': H_epsilon_3, '3HB': H_beta_3, 'CE': C_epsilon, 'CG': C_gamma, 'CB': C_beta, }, ), ]
pdb_alternative = {'1HB': '3HB', '1HG': '3HG', 'HG1': '3HG', 'HB3': '3HB', 'HG3': '3HG', 'HB1': '3HB', 'HE3': '3HE', 'HE2': '2HE', 'HE1': '1HE', 'HG2': '2HG', 'HB2': '2HB', }
amber_atom_type = {H_epsilon_1: 'H1', H_epsilon_3: 'H1', H_epsilon_2: 'H1', C_epsilon: 'CT', S_delta: 'S', H_gamma_3: 'H1', H_gamma_2: 'H1', H_beta_2: 'HC', H_beta_3: 'HC', C_gamma: 'CT', C_beta: 'CT', }
amber12_atom_type = {H_epsilon_1: 'H1', H_epsilon_3: 'H1', H_epsilon_2: 'H1', C_epsilon: 'CT', S_delta: 'S', H_gamma_3: 'H1', H_gamma_2: 'H1', H_beta_2: 'HC', H_beta_3: 'HC', C_gamma: '2C', C_beta: '2C', }
